Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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