Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms