Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rd3lB2RV38 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms