Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms