Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Znf518bB2RRE4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf518bB2RRE4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms