Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms