Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms