Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uhrf1bp1B2KF50 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms