Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brpf3B2KF05 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms