Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trabd2bB1ATG9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms