Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spocd1B1ASB6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms