Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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