Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl41A2AUC9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms