Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtcflA2APF3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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