Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SetxA2AKX3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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