Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calcoco2A2A6M5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms