Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Krtap29-1A2A5X4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms