Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27029A2A4P4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms