Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17087V9GXQ2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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