Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm4T1NXB5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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