Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Crlf3Q9Z2L7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Crlf3Q9Z2L7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms