Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtmr1Q9Z2C4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms