Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms