Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms