Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3b1Q9Z1T1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms