Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ror1Q9Z139 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms