Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdh20Q9Z0M3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdh20Q9Z0M3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms