Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme3Q9WV85 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nme3Q9WV85 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms