Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Apobec2Q9WV35 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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