Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scnn1bQ9WU38 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms