Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms