Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp11cQ9QZW0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms