Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Trpc3Q9QZC1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpc3Q9QZC1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Trpc3Q9QZC1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc3Q9QZC1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trpc3Q9QZC1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trpc3Q9QZC1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc3Q9QZC1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trpc3Q9QZC1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Trpc3Q9QZC1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc3Q9QZC1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Trpc3Q9QZC1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc3Q9QZC1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Trpc3Q9QZC1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc3Q9QZC1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc3Q9QZC1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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