Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnnt3Q9QZ47 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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