Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp1Q9QY53 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms