Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pkp3Q9QY23 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp3Q9QY23 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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