Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms