Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms