Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms