Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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