Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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