Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dclk1Q9JLM8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms