Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmgn5Q9JL35 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmgn5Q9JL35 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms