Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scamp5Q9JKD3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms