Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms