Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms