Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfhx4Q9JJN2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms