Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms