Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smad9Q9JIW5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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