Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1fQ9JIS7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1fQ9JIS7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms